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役員報酬を資金繰りの都合により、たまに未払金とするのはよくある例で、賃金台帳にも支給すべき報酬、預るべき所得税を整理記入しておけば、問題なしと税理士の指導を受けたことがあります。

ご質問のように、役員報酬を数ｶ月間も、しかも一部（一定額）を未払金計上することは、租税回避のため役員報酬を遡って増額支給することにしたとみなされ、未払分は賞与扱いとなり損金処理は認められないのではないかと考えます。
この点は、税務の専門家に未払とした事情をお話しのうえ、処理されてはと思います。

＞また、役員報酬が４０万円ですが、うち非課税交通費１万円がある場合、徴収する所得税は３９万円に対する金額なのでしょうか。

役員報酬に通勤手当を含めて支給していれば、おたずねのとおり、所得税は課税分３９万円に対する金額となります。

役員報酬を資金繰りの都合により、たまに未払金とするのはよくある例で、賃金台帳にも支給すべき報酬、預るべき所得税を整理記入しておけば、問題なしと税理士の指導を受けたことがあります。

ご質問のように、役員報酬を数ｶ月間も、しかも一部（一定額）を未払金計上することは、租税回避のため役員報酬を遡って増額支給することにしたとみなされ、未払分は賞与扱いとなり損金処理は認められないのではないかと考えます。
この点は、税務の専門家に未払とした事情をお話しのうえ、処理されてはと思います。

＞また、役員報酬が４０万円ですが、うち非課税交通費１万円がある場合、徴収する所得税は３９万円に対する金額なのでしょうか。

役員報酬に通勤手当を含めて支給していれば、おたずねのとおり、所得税は課税分３９万円に対する金額となります。

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こちらで熱く激しく論じられています。

http://www.otasuke.ne.jp/modules/newbb/viewtopic.php?topic_id=7190&forum=1&viewmode=flat&order=ASC&start=0

http://www.otasuke.ne.jp/modules/newbb/viewtopic.php?topic_id=7243&forum=1

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sebiraさんありがとうございます。
勉強になりました。
未払分が賞与扱いと一緒になると困りますね。
いろんな説があって迷うことが多いです。
一時的なものは大丈夫だと思いますが、毎月未払いが続くようならダメってことですね。
交通費の件もありがとうございました！

dasrechtさんありがとうございます。
教えて頂いたスレッド、拝見させていただきました。
頭の悪い私は「？？」となることもしばしばですが、再度ゆっくり読んで理解していきたいと思います。

税理士さんによって回答が違う…ということがよくありますね。
統一してもらいたいと思うことがしばしばあります。
経理って難しいですね。

sebiraさんありがとうございます。
勉強になりました。
未払分が賞与扱いと一緒になると困りますね。
いろんな説があって迷うことが多いです。
一時的なものは大丈夫だと思いますが、毎月未払いが続くようならダメってことですね。
交通費の件もありがとうございました！

dasrechtさんありがとうございます。
教えて頂いたスレッド、拝見させていただきました。
頭の悪い私は「？？」となることもしばしばですが、再度ゆっくり読んで理解していきたいと思います。

税理士さんによって回答が違う…ということがよくありますね。
統一してもらいたいと思うことがしばしばあります。
経理って難しいですね。

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