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生命保険料控除については、基本的に契約者が誰であるかは問われません。

http://www.nta.go.jp/taxanswer/shotoku/1140.htm
http://www.nta.go.jp/taxanswer/shotoku/1140_qa.htm#q1

適用の対象となるのは、分かりやすく書けば、次のような感じです。

(1)保険金などの受取人のすべてを自分か又はその配偶者、その他の親族とする生命保険契約等
(2)その保険料を実際に支払っている者

まず、(1)についてですが、問題となるのは受取人であって、しかも扶養親族であることも、生計を一である事も要件とされておらず、配偶者や親族であればOKという事になります。
ですから、受取人は親族である父になっている訳ですから、この条件はクリアしていますね。

次に、(2)ですが、一般的には、契約者＝保険料負担者、というパータンがほとんどとは思いますが、所得税法上では、誰が保険料を支払っているかがポイントであって、契約者が誰であるかは問われませんので、その社員の方が実際に支払っているという事であれば、控除できる事となりますし、そのように会社に対して申告されているのであれば、会社としては控除すべき事となります。

ただ、年末調整とは直接関係ありませんが、保険金受取人と違う者が保険料を負担した場合には、満期による保険金受取時には、その負担した部分は、社員Aから父へ贈与があったものとされますので、お父様に対して贈与税がかかってくるという事になります。
それも含めて、間違いなく、社員Aが負担している、と申告されるのであれば、それに従うしかないものと思います。
http://www.nta.go.jp/taxanswer/shotoku/1755.htm

生命保険料控除については、基本的に契約者が誰であるかは問われません。

http://www.nta.go.jp/taxanswer/shotoku/1140.htm
http://www.nta.go.jp/taxanswer/shotoku/1140_qa.htm#q1

適用の対象となるのは、分かりやすく書けば、次のような感じです。

(1)保険金などの受取人のすべてを自分か又はその配偶者、その他の親族とする生命保険契約等
(2)その保険料を実際に支払っている者

まず、(1)についてですが、問題となるのは受取人であって、しかも扶養親族であることも、生計を一である事も要件とされておらず、配偶者や親族であればOKという事になります。
ですから、受取人は親族である父になっている訳ですから、この条件はクリアしていますね。

次に、(2)ですが、一般的には、契約者＝保険料負担者、というパータンがほとんどとは思いますが、所得税法上では、誰が保険料を支払っているかがポイントであって、契約者が誰であるかは問われませんので、その社員の方が実際に支払っているという事であれば、控除できる事となりますし、そのように会社に対して申告されているのであれば、会社としては控除すべき事となります。

ただ、年末調整とは直接関係ありませんが、保険金受取人と違う者が保険料を負担した場合には、満期による保険金受取時には、その負担した部分は、社員Aから父へ贈与があったものとされますので、お父様に対して贈与税がかかってくるという事になります。
それも含めて、間違いなく、社員Aが負担している、と申告されるのであれば、それに従うしかないものと思います。
http://www.nta.go.jp/taxanswer/shotoku/1755.htm

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新卒さん（高校卒）とかでは多いですよね。
契約したときは保護者が契約されてるのが普通なので。
来年の年調までには契約者変更してた方がいいですよって教えてあげればどうでしょうか？

新卒さん（高校卒）とかでは多いですよね。
契約したときは保護者が契約されてるのが普通なので。
来年の年調までには契約者変更してた方がいいですよって教えてあげればどうでしょうか？

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