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お世話になっております。
ある社員について、有休を消化後、さらに休業したので6月分給与から欠勤控除として差し引くことになりました。（前例がありません）
社会保険料、所得税の算出の際は、控除後の金額を基にしてよいのでしょうか？
6月分給与は算定基礎届にも影響しますので、どのように考えればよいのでしょう。
よろしくお願いいたします。

お世話になっております。
ある社員について、有休を消化後、さらに休業したので6月分給与から欠勤控除として差し引くことになりました。（前例がありません）
社会保険料、所得税の算出の際は、控除後の金額を基にしてよいのでしょうか？
6月分給与は算定基礎届にも影響しますので、どのように考えればよいのでしょう。
よろしくお願いいたします。