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まず燃料代が通勤手当とみなされます。
支給した燃料代が通勤距離に応じて決められた
限度額を超える場合、原則として超えた分は
給与として課税されます。
http://www.nta.go.jp/taxanswer/gensen/2585.htm
（社用車の提供も、厳密に言えば経済的利益の
提供となり、賃借料相当分を通勤手当に含めよ、
と言われても反論できないところです。
まあ、もし追及されたとしても大した額には
ならないだろうとは思いますが・・・）

それぞれの自宅近くに、帰宅時に駐車する際の費用を
会社で負担するということですと、
駐車場代は基本的に給与であり課税対象です。

ただ、前記の燃料代と、この駐車場代を合わせたものを
通勤手当と考えて、合計額が先の非課税限度額を
超えた分だけを課税給与として扱う、という処理は
認められる余地があるようです。

まず燃料代が通勤手当とみなされます。
支給した燃料代が通勤距離に応じて決められた
限度額を超える場合、原則として超えた分は
給与として課税されます。
http://www.nta.go.jp/taxanswer/gensen/2585.htm
（社用車の提供も、厳密に言えば経済的利益の
提供となり、賃借料相当分を通勤手当に含めよ、
と言われても反論できないところです。
まあ、もし追及されたとしても大した額には
ならないだろうとは思いますが・・・）

それぞれの自宅近くに、帰宅時に駐車する際の費用を
会社で負担するということですと、
駐車場代は基本的に給与であり課税対象です。

ただ、前記の燃料代と、この駐車場代を合わせたものを
通勤手当と考えて、合計額が先の非課税限度額を
超えた分だけを課税給与として扱う、という処理は
認められる余地があるようです。

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回答ありがとうございます。

燃料代ですが、給与や立替旅費として支給しているのではなく、
会社名義のガソリンスタンドのカードで引落になっているので
各自に通勤分として出している燃料代の詳細はわかりません。
（どうしましょう・・・）

駐車代は、給料の扱いになるのですね。

回答ありがとうございます。

燃料代ですが、給与や立替旅費として支給しているのではなく、
会社名義のガソリンスタンドのカードで引落になっているので
各自に通勤分として出している燃料代の詳細はわかりません。
（どうしましょう・・・）

駐車代は、給料の扱いになるのですね。

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最悪の場合を想定すると、
「従業員の通勤に使われた部分を算出して
その分は通勤手当とせよ、
その上で非課税限度額を超えた部分は
源泉徴収がされていなければ源泉徴収漏れとする」
と言われるおそれがあります。

通勤部分と営業部分を物理的に分別できるのが
ベストですが、各人の通勤距離からの概算などでも
根拠としてあった方が無いよりは良いと思います。

先に書きましたとおり、燃料代で使われていない
非課税枠が残っていれば、駐車場代のうち
その残額部分は課税給与としない処理も
検討の余地はあると思いますので、
上記燃料代の管理方法と併せて
税理士等と相談されることをお奨めします。

最悪の場合を想定すると、
「従業員の通勤に使われた部分を算出して
その分は通勤手当とせよ、
その上で非課税限度額を超えた部分は
源泉徴収がされていなければ源泉徴収漏れとする」
と言われるおそれがあります。

通勤部分と営業部分を物理的に分別できるのが
ベストですが、各人の通勤距離からの概算などでも
根拠としてあった方が無いよりは良いと思います。

先に書きましたとおり、燃料代で使われていない
非課税枠が残っていれば、駐車場代のうち
その残額部分は課税給与としない処理も
検討の余地はあると思いますので、
上記燃料代の管理方法と併せて
税理士等と相談されることをお奨めします。

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やはり、税理士さんと相談した方が良さそうですね。
ご丁寧な回答ありがとうございました。

やはり、税理士さんと相談した方が良さそうですね。
ご丁寧な回答ありがとうございました。

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