実際の状況がわからない事には何とも言えませんが、税務調査が終わった、というのは、単に調査官が調べるのは今日までで終わりです、という感じで言われただけなのか、それとも、その数日後に連絡があって、これにて終わり、という感じで言われたのでしょうか？
基本的に、調べる事自体は終わっても、担当調査官の直属上司（一般的には統括調査官）の決裁がおりて、会社に、否認等があれば修正申告の慫慂があったり、何もなければその旨が伝えられたり、という事で最終的に終わるのが一般的と思います。
ですから、前者（担当調査官が今日で終わり、という感じ）であれば、ただ単に最終的な確認で来られるだけかも知れませんが、そうでなくその後の最終的な連絡があったにも関わらず、また連絡があったのであれば、いろいろと考えてしまいますよね〜。
ひょっとして、関連する会社の調査に入っていて（たまたま同時期だったのか、最初から狙ってか、はわかりませんが）、そちらの調査した結果の絡みから何か出てきたのか、それとも、単に、それとは関係なく、取引先の資料収集（今後の取引先への調査の資料とする為）の目的で、資料を記録させて欲しい、という事だけかもしれませんし、何とも言えない所ですね。
もしも前者であれば、そんなに怖れることもないような気はしますが。
実際の状況がわからない事には何とも言えませんが、税務調査が終わった、というのは、単に調査官が調べるのは今日までで終わりです、という感じで言われただけなのか、それとも、その数日後に連絡があって、これにて終わり、という感じで言われたのでしょうか？
基本的に、調べる事自体は終わっても、担当調査官の直属上司（一般的には統括調査官）の決裁がおりて、会社に、否認等があれば修正申告の慫慂があったり、何もなければその旨が伝えられたり、という事で最終的に終わるのが一般的と思います。
ですから、前者（担当調査官が今日で終わり、という感じ）であれば、ただ単に最終的な確認で来られるだけかも知れませんが、そうでなくその後の最終的な連絡があったにも関わらず、また連絡があったのであれば、いろいろと考えてしまいますよね〜。
ひょっとして、関連する会社の調査に入っていて（たまたま同時期だったのか、最初から狙ってか、はわかりませんが）、そちらの調査した結果の絡みから何か出てきたのか、それとも、単に、それとは関係なく、取引先の資料収集（今後の取引先への調査の資料とする為）の目的で、資料を記録させて欲しい、という事だけかもしれませんし、何とも言えない所ですね。
もしも前者であれば、そんなに怖れることもないような気はしますが。