簿記の仕訳としては正しいのですが、問題は消費税なんですよね。

建物を1,000,000円で売却したのですから、課税売上げ1,000,000円（税込）とならないと困ります。

そのため、売却による課税売上げの計上と、売却損益の計算を別々にわけて考えます。


＜税込経理の場合の仕訳例＞
消費税コードは、a・・・課税売上げ、z・・・対象外取引、とします。

1.売却代金を全額収益（課税売上げ）とします。
　○○預金　1,000,000　／　建物売却益　1,000,000（a）

2.建物の簿価を費用損失に計上します。
　建物売却損　5,000,000（z）　／　建物　5,000,000

3.売却益と売却損を相殺します。
　建物売却益　1,000,000（ｚ）　／　建物売却損1,000,000（ｚ）

なお、建物売却益、建物売却損は、固定資産売却益、固定資産売却損でもＯＫです。


これで、損益計算書上の建物売却損は、5,000,000−1,000,000＝4,000,000円になっていますから、最初にstepさんがした仕訳とまったく同じになっていますね。

また、消費税の課税売上げは、消費税コード（a）のついている収益ですから、1,000,000円のみです。

これで損益計算書の建物売却損も、消費税の課税売上げもバッチリＯＫですね。