・デポジット500円の処理方法(個人負担にするか会社負担にするか)
 出張交通費の話ですよね。業務にかかる費用を個人負担にするなんて事は考えられません。

・チャージ金の取扱い(仮払金か旅費交通費か)
 どちらでもいいと思います。決算時にきちんと資産と費用に振り替えれば。